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針對超級細菌NDM-1入侵台灣後，如何做感染控制才好，台大醫院小兒部感染科醫師呂俊毅在受訪時指出，此菌株可能存活幾個月到幾年，甚至一輩子，個案不可能一直留院觀察，衛生單位要注意的是院內感染控制。另外，長庚醫院感染科主任黃景泰則主張，可先居家隔離，並視情形調整公衛措施，民眾也要養成勤洗手的習慣。
針對是否需要隔離的問題，衛生署長楊志良今天在立法院答詢時表示，超級細菌不同於新流感，把帶原者隔離在醫院內，反而不利院內感染控制（因醫院多為抵抗力低、且使用抗生素病患），個案回到家中只要做好個人衛生，就不會有問題，而超級細菌是經由傷口感染，並非飛沫傳染，要有不一樣的處置方式。
